刚做的豆腐发酸通常是由于保存不当或制作过程中细菌污染导致，建议直接丢弃避免食用。豆腐酸味可能由储存温度过高、接触生水或容器不洁等因素引起，变质豆腐可能含有致病菌，食用后易引发胃肠不适。
豆腐富含蛋白质和水分，在常温下极易滋生微生物。家庭自制豆腐若未彻底煮沸或使用未消毒的器具，乳酸菌等杂菌会快速繁殖分解蛋白质产生酸味。夏季室温超过4小时或冷藏超过3天的豆腐易出现酸腐现象，表面可能伴随黏液或颜色变暗。
特殊情况下，传统工艺使用的凝固剂如盐卤过量可能导致轻微酸涩感，但不会产生明显腐败气味。若豆腐仅边缘微酸而中心无异味，可切除变质部分后高温烹煮食用，但孕妇、儿童及胃肠敏感者仍应避免。部分发酵豆腐制品如毛豆腐会有正常酸香，需与变质酸味区分。
日常制作豆腐应使用沸水消毒容器，点浆后尽快用冷水降温。短期保存需浸没于煮沸过的凉开水中冷藏，建议2日内食用完毕。发现酸味豆腐可观察是否伴随发黏、变色或异味，变质豆腐即使加热也无法完全消除毒素。选择新鲜黄豆、控制凝固剂用量及严格杀菌能有效预防豆腐酸败，出现可疑酸味时宁可舍弃也不要冒险食用。
