白萝卜生吃发辣主要与硫代葡萄糖苷分解产生的异硫氰酸酯类物质有关，这类成分对口腔黏膜有刺激性。白萝卜的辣味程度受品种差异、种植条件、储存时间等因素影响。
白萝卜中含有丰富的硫代葡萄糖苷，在细胞破裂时会与内源性酶作用生成异硫氰酸酯。这类活性物质具有挥发性辛辣气味，能刺激舌部痛觉神经末梢，产生灼热感。不同品种中硫代葡萄糖苷含量差异较大，表皮颜色较深、肉质致密的品种通常辣味更明显。春季采收的萝卜因生长周期短，辛辣物质积累较少，而秋冬萝卜为抵御低温会合成更多防御性物质。
部分特殊品种通过人工选育已降低辛辣成分含量，如水果萝卜的硫代葡萄糖苷含量仅为普通品种的三分之一。长时间储存会使硫代葡萄糖苷逐渐分解，故冷藏后的萝卜辣味减轻。土壤中硫元素含量过高也会促进辛辣物质合成，适当控制施肥可改善口感。
对辣味敏感者可选择焯水或加糖凉拌，高温会使异硫氰酸酯挥发，糖分能中和刺激性味道。白萝卜中的芥子油苷类物质具有抗氧化和抗炎作用，适量摄入有助于促进消化液分泌。胃肠功能较弱者应控制生食量，避免空腹食用引发不适。
