新鲜紫菜通常建议焯水后再食用，直接生吃可能影响消化吸收并存在卫生风险。
新鲜紫菜含有较多藻胶和粗纤维，直接生吃时质地较硬，可能刺激胃肠黏膜，部分人群会出现腹胀不适。焯水处理能软化纤维结构，使口感更柔嫩，同时高温可灭活表面附着的海洋微生物或寄生虫卵。紫菜中的藻红蛋白等活性成分在短时间焯烫后仍能保留大部分营养价值，且更利于碘元素释放。
极少数对海藻类过敏或胃肠功能极弱的人群，即使焯水后也可能出现不适，这类情况应避免食用。新鲜紫菜可能存在近海污染风险，若未经充分加热，重金属等有害物质残留概率较高。部分特殊品种紫菜含有天然毒素，需长时间烹煮才能分解，直接生吃存在安全隐患。
日常食用建议将紫菜放入沸水中焯烫10-20秒，捞出后凉拌或做汤。搭配富含维生素C的番茄、柠檬等食材可促进铁吸收，避免与高鞣酸食物同食影响矿物质利用。甲状腺疾病患者需控制摄入量，浸泡焯水能减少部分碘含量。购买时选择色泽黑亮、无腥臭味的优质紫菜，冷藏保存不超过3天，焯水后尽快食用完毕。