中医治疗肛瘘主要通过内服中药、外治法、针灸、饮食调理和生活干预等方式综合干预。肛瘘多由湿热下注、气血瘀滞或正气不足所致，中医强调辨证施治与整体调理相结合。
1、内服中药
根据证型选用清热解毒、活血化瘀或补益气血的方剂。湿热型常用黄连解毒汤加减，含黄连、黄柏等成分；瘀血型可选桃红四物汤，含桃仁、红花等；虚证患者可能使用补中益气汤。中药需由医师根据舌脉辨证开具，避免自行用药。
2、外治法
包括熏洗坐浴与药物外敷。苦参汤熏洗可清热燥湿，五倍子散外敷有助于收敛瘘管。溃烂期可用九华膏生肌敛疮，形成期可配合红油膏拔脓祛腐。外用药需在清洁创面后使用，避免感染加重。
3、针灸疗法
选取长强、承山等穴位针刺，配合艾灸关元、足三里以扶正祛邪。针灸能改善局部气血循环，减轻疼痛肿胀，对单纯性肛瘘辅助效果较好。需由专业医师操作，出血体质或孕妇慎用。
4、饮食调理
忌食辛辣油腻，推荐马齿苋粥、赤小豆薏仁汤等清热利湿食疗方。适量食用黑木耳、山药等补益食材，避免饮酒及发物。饮食需配合体质调整，湿热证者宜清淡，虚寒者需温补但忌滋腻。
5、生活干预
保持肛门清洁干燥，便后可用淡盐水清洗。避免久坐久站，练习提肛运动增强括约肌功能。规律作息以减少湿热内生，情绪调节可防止肝郁气滞加重病情。合并糖尿病等基础病需同步控制。
中医治疗需坚持3-6个月，复杂瘘管或反复化脓者建议结合西医手术。治疗期间观察分泌物性状变化，出现发热、剧痛需及时复诊。日常可练习八段锦调节气血，穿宽松棉质内衣减少摩擦，避免用力排便加重瘘管损伤。