秦艽具有祛风湿、清湿热、止痹痛等功效，主要用于风湿痹痛、筋脉拘挛、骨节酸痛等病症的治疗。
1、祛风湿
秦艽含有龙胆苦苷等活性成分，能抑制炎症因子释放，减轻关节滑膜水肿和炎性渗出。对于风湿性关节炎引起的关节肿胀、晨僵等症状有缓解作用，常与防风、独活等配伍使用。风湿痹痛急性发作期可配合非甾体抗炎药增强疗效，但需注意避免长期大剂量使用。
2、清湿热
秦艽苦寒沉降的特性有助于清除下焦湿热，对湿热黄疸、小便不利等症状有效。其提取物能促进胆汁分泌，降低血清胆红素水平。治疗肝胆湿热时多与茵陈、栀子同用，现代研究显示其保肝作用与调控NF-κB信号通路有关。
3、止痹痛
通过抑制前列腺素E2合成和缓激肽生成，秦艽可显著改善神经根性疼痛和肌肉痉挛。对腰椎间盘突出导致的坐骨神经痛有辅助治疗效果，临床常与杜仲、桑寄生组成复方。动物实验证实其镇痛效果与吗啡相比无成瘾性。
4、退虚热
针对阴虚内热导致的骨蒸潮热、盗汗等症，秦艽能通过调节T淋巴细胞亚群比例发挥免疫调节作用。常与知母、地骨皮配伍治疗结核病发热，其乙醇提取物对结核杆菌有中度抑制作用。
5、通经络
秦艽可扩张微血管，改善局部血液循环，有助于消除经络阻滞。对中风后肢体麻木、屈伸不利有改善作用，现代制剂如秦艽注射液可用于缺血性脑卒中的辅助治疗。
使用秦艽时需辨证施治，风寒湿痹者宜酒制以增强温通之性，阴虚血燥者慎用。常规煎服用量为3-9克，超量可能引起恶心、腹泻等不良反应。建议在中医师指导下配伍使用，服药期间忌食生冷油腻。孕妇及哺乳期妇女应在医师评估后使用，儿童用药需严格调整剂量。储存时需置阴凉干燥处，防止有效成分分解。