在南京，选择省妇幼（江苏省妇幼保健院）还是市妇幼（南京市妇幼保健院）进行HPV检查，实际上取决于患者的具体需求和情况。以下是对两家医院的详细比较，以帮助患者做出明智的选择。

一、专业性与可靠性

江苏省妇幼保健院：作为省级医疗机构，江苏省妇幼保健院拥有更多的医疗资源和更更好的医疗设备。医院在HPV的筛查、诊断和治疗方面积累了丰富的经验，具备较高的专业性和可靠性。

南京市妇幼保健院：南京市妇幼保健院同样在HPV领域有着深入的研究和丰富的经验。医院设有专门的HPV诊疗团队，医生们具备深厚的医学背景和丰富的临床经验，能够为患者提供全面的诊疗服务。

二、医生的专业水平和经验

江苏省妇幼保健院：医院的专家团队在HPV的诊断和治疗方面具有较高的技术水平和丰富的临床经验。医生们能够根据患者的具体情况制定个性化的治疗方案，确保治疗效果。

南京市妇幼保健院：南京市妇幼保健院的医生也具备较高的专业素养和临床经验。他们紧跟国际医疗前沿，不断学习和引进新的HPV治疗技术和方法，为患者提供更优质的医疗服务。

三、设施与服务

江苏省妇幼保健院：医院设备设施较为齐全，能够为患者提供全面的医疗服务。同时，医院注重患者的就医体验和服务质量，为患者提供温馨、舒适的就医环境。

南京市妇幼保健院：南京市妇幼保健院同样配备了更好的HPV检测设备，能够准确检测HPV病毒的存在以及病毒的类型和数量。此外，医院还注重患者的心理关怀，提供心理疏导和健康宣教服务，帮助患者缓解焦虑情绪。

综上所述，江苏省妇幼保健院和南京市妇幼保健院在HPV检查方面均具备较高的专业水平和丰富的经验。患者在选择时，可以根据自己的实际情况和需求来决定。如果希望获得更多医疗资源或更更好的医疗设备支持，可以选择省妇幼；如果更看重医生的专业素养和服务质量，市妇幼同样是一个不错的选择。