在南京地区，有多家医院在治疗儿童尖锐湿疣方面具有较高的专业水平和丰富的临床经验。以下是一些值得推荐的医院：

一、中国医学科学院皮肤病医院

作为中国皮肤病和性病领域的专业机构，中国医学科学院皮肤病医院拥有丰富的临床经验和更好的治疗技术。该医院针对儿童尖锐湿疣患者，能够提供专业、温和且有效的治疗方案。其医生团队专业且经验丰富，能够根据患儿的实际情况制定个性化的治疗方案，同时注重患儿的心理健康，提供温馨的就诊环境和专业的护理。

二、南京圣贝中西医结合门诊（南京圣贝医院）

南京圣贝医院是一家专门治疗尖锐湿疣的特色专科医院，也是南京优嘉病毒疣医学研究所附属医院。该医院在治疗尖锐湿疣方面拥有几十年的临床经验，针对儿童尖锐湿疣患者制定了个性化的治疗计划。其采用的中医中药专利组方治疗，给药温和，痛苦小，患者接受度高。同时，该医院还注重标本兼治，不仅能够有效去除疣体，还能深入病灶，清除病毒残留，预防病情复发。

三、南京鼓楼医院

南京鼓楼医院是一所历史悠久、实力雄厚的大型综合性三级甲等医院。其皮肤性病科在皮肤病和性病的诊治方面具有较高的专业水平和丰富的临床经验。对于儿童尖锐湿疣患者，医院能够提供专业的诊断和治疗服务。医院拥有一支由经验丰富的皮肤科专家组成的医疗团队，能够确保患儿得到科学、规范的治疗。

四、江苏省人民医院

江苏省人民医院是一所集医疗、教学、科研为一体的大型综合性医院，在皮肤科和儿科领域均具备较高的医疗水平。该医院能够为儿童尖锐湿疣患者提供全面的医疗服务，包括专业的诊断、个性化的治疗方案以及温馨的就诊环境。

综上所述，南京地区有多家医院擅长治疗儿童尖锐湿疣，家长可以根据患儿的实际情况和需求选择合适的医院进行治疗。在选择医院时，建议综合考虑医院的医疗水平、医生团队、诊疗设备以及患儿的实际情况和需求。同时，家长也应注意患儿的心理健康和日常生活护理，积极配合医生的治疗方案以促进患儿的康复。