湿西瓜子短期保存建议冷藏，长期保存更适合冷冻。西瓜子水分含量较高，冷藏可保持3-5天口感，冷冻能延长保存时间至1个月以上，但需注意密封防潮。
湿西瓜子冷藏时，水分和质地变化较慢，能维持脆嫩口感，适合近期食用。冷藏温度抑制细菌滋生，但无法完全阻止霉变，需用保鲜盒或密封袋隔绝冰箱异味。若表面出现黏腻或酸味应立即丢弃。冷藏后可直接食用或短暂回温，不影响风味。
冷冻会使西瓜子内部水分结晶，解冻后可能出现轻微软化，但营养流失较少。冷冻前需沥干水分并分装，避免结霜粘连。解冻建议自然回温或微波炉低火处理，高温解冻易导致口感变韧。冷冻适合制作量较大或需长期保存的情况，如烘焙原料备用。反复冻融会加速品质下降，建议单次解冻后尽快食用。
无论冷藏或冷冻，保存前需彻底清洗西瓜子并晾干表面水分，避免残留果肉发酵变质。密封容器选择玻璃或食品级塑料材质，减少异味吸附。若用于烹饪，冷冻西瓜子可直接加入热食无需解冻。日常保存建议少量多次处理，保持食材新鲜度。特殊体质人群如胃肠敏感者，建议冷藏保存并在24小时内食用完毕。
