湿西瓜子可以通过干燥密封、低温冷藏、真空保存、防潮剂辅助、定期检查等方法延长保存时间。潮湿环境容易导致霉变或氧化变质，需特别注意防潮和避光。
1、干燥密封
将湿西瓜子均匀铺在干燥通风处晾晒，或用食品烘干机低温脱水至完全干燥。彻底干燥后装入密封罐或食品级自封袋，排除袋内空气后封口。密封容器建议选择不透光的材质，避免光照加速脂肪氧化。此法适合短期储存，需放置于阴凉处。
2、低温冷藏
干燥后的西瓜子可装入保鲜盒放入冰箱冷藏层，温度控制在4℃左右。冷藏能有效抑制微生物繁殖，但需注意密封严实，防止吸收冰箱内潮气。若储存超过两周，建议分装成小份以减少反复开合导致的湿度变化。冷藏后食用前可略微烘烤恢复酥脆口感。
3、真空保存
使用家用真空机将干燥西瓜子抽真空包装，能隔绝氧气和水分，延长保质期至3-6个月。真空袋宜选用厚实材质防止破损，每袋分量以一次食用量为宜。开封后若未吃完，需重新抽真空或改用其他密封方式储存。此法对设备有要求但防变质效果最佳。
4、防潮剂辅助
在密封容器中放入食品级干燥剂或脱氧剂，可吸附残留水分和氧气。硅胶干燥剂需定期更换，脱氧剂多为一次性使用。注意防潮剂不可直接接触瓜子，需用纱布隔开。此法适合湿度较高的南方地区，配合密封容器使用效果更佳。
5、定期检查
储存期间每两周检查瓜子状态，观察是否有受潮变软、霉斑或哈喇味。轻微受潮可复烘后更换干燥剂，已霉变需立即丢弃。建议在容器外标注储存日期，优先食用较早批次。若发现虫卵或蛀孔，需彻底清理储存环境。
西瓜子含丰富不饱和脂肪酸，储存不当易酸败产生有害物质。除上述方法外，建议购买时选择新鲜原料，处理前剔除破损籽粒。少量多次加工能保证食用新鲜度，开封后尽量一周内吃完。若长期保存可考虑冷冻，但解冻后口感略有影响。日常食用量以每日20-30克为宜，避免过量摄入油脂。
