甲鱼公母均有滋补价值，但公甲鱼更适合温补肾阳，母甲鱼侧重滋阴养血。甲鱼滋补效果主要取决于生长年限、养殖环境及食用方式，公母差异并非绝对。
公甲鱼体内雄性激素含量较高，传统中医认为其具有更强的壮阳益精功效，适合肾阳虚引起的腰膝酸软、畏寒肢冷人群。公甲鱼背甲较厚且肉质紧实，胶原蛋白含量略高，长时间炖煮后汤质更为浓稠。搭配枸杞、山药等食材可增强补气固本作用，但阴虚火旺者过量食用可能引发口干舌燥等不适。
母甲鱼卵泡及脂肪组织含有丰富磷脂与不饱和脂肪酸，对改善皮肤干燥、月经不调等阴血不足症状更有优势。其肉质相对细腻，适合与百合、麦冬等滋阴药材同炖。孕期或产后女性食用母甲鱼汤时需注意去除内脏脂肪，避免胆固醇摄入过量。甲鱼公母均含有较高嘌呤，痛风患者应控制食用量。
选择甲鱼时不必过度纠结公母差异，新鲜度与烹饪方式对营养保留更重要。建议隔水清炖保留更多活性物质，搭配生姜可中和寒性。慢性病患者食用前应咨询中医师，避免与特定药物同服。每周食用不超过两次，每次控制在200克以内为宜，搭配膳食纤维丰富的蔬菜可促进代谢。
