苹果放进冷冻和冷藏是两种不同的保鲜方式，冷冻会导致苹果细胞结构破坏，冷藏则能延缓成熟。苹果冷冻后解冻会变软出水，冷藏可保持脆度但长期存放仍会变质。
冷冻环境下苹果内部水分会形成冰晶，刺破细胞壁导致质地改变。解冻后细胞液流失使果肉绵软，口感显著下降，适合用于烘焙或制作果酱。冷冻苹果前可去皮切块，减少氧化变色，密封保存避免串味。维生素C等水溶性营养素在冷冻过程中流失较多，但膳食纤维和矿物质相对稳定。
冷藏温度能抑制苹果呼吸作用，减缓乙烯释放，延缓后熟过程。低温环境下果皮可能因冷害出现褐斑，但不影响食用。冷藏苹果建议用保鲜袋隔离水汽，避免与其他蔬果混放加速腐败。冷藏超过两周的苹果会逐渐失水皱缩，甜度虽增加但营养价值降低。
日常保存苹果建议根据食用计划选择方式，短期存放冷藏更佳，长期保存可冷冻处理。无论哪种方式，都应选择无磕碰的完好果实，清洗擦干后再储存。苹果冷藏时避免与香蕉等乙烯释放量大的水果同放，冷冻前预处理可提升食用品质。若发现霉变或异味应立即丢弃，避免摄入变质食物引发胃肠不适。