紫菜存放三到四年通常不建议食用。干制紫菜的保质期一般为12-18个月，长期储存可能因受潮霉变或营养流失产生健康风险。
干制紫菜在密封避光条件下保存时，水分含量低于10%可抑制微生物生长，但超过保质期后易受环境湿度影响。紫菜中的蛋白质和游离氨基酸会随储存时间延长逐渐降解，鲜味物质如谷氨酸含量明显下降。若包装破损或存放环境湿度超过60%，可能滋生霉菌产生黄曲霉毒素等有害物质，高温高湿环境会加速这一过程。
特殊情况下真空包装且恒温恒湿保存的紫菜，经专业机构检测未霉变且各项指标合格时或可食用。但家庭储存难以达到工业级密封标准，紫菜表面可能出现肉眼不可见的菌丝体增殖。2012年食品安全国家标准明确规定藻类干制品霉菌限量标准，过期紫菜即使高温烹煮也无法完全破坏某些霉菌毒素。
建议购买时选择小包装紫菜并在保质期内食用完毕，开封后需密封冷藏。若发现紫菜有霉斑、哈喇味或质地变黏，应立即丢弃。日常可将紫菜置于干燥剂罐中保存，避免与海鲜干货混放防止串味变质。烹饪前可观察色泽是否均匀、闻有无海藻清香，劣质紫菜冲泡后汤色浑浊需警惕。