皮皮虾短期保存可放冷藏，长期保存建议冷冻。皮皮虾的保存方式主要取决于存放时间、新鲜度及后续烹饪需求。
冷藏适合1-2天内食用的情况。新鲜皮皮虾放入保鲜盒或密封袋，覆盖湿润厨房纸后置于冰箱冷藏室下层，温度控制在0-4摄氏度。冷藏能最大限度保留虾肉弹性和鲜甜，适合白灼、清蒸等强调原味的烹饪方式。但需注意冷藏环境湿度不足可能导致虾头变黑，建议尽快食用。
冷冻可保存1个月左右，适合大量采购或延迟食用。清洗后的皮皮虾沥干水分，按单次用量分装进密封袋，排出空气后放入-18摄氏度以下冷冻室。冷冻能有效抑制细菌繁殖，但反复解冻会破坏肉质纤维，解冻后适宜做椒盐、辣炒等重口味料理。若虾体表面出现冰晶或发黄则提示冻存时间过长。
无论冷藏或冷冻，保存前均需剔除死虾以避免腐败扩散。冷冻皮皮虾建议流水快速解冻，烹饪前用姜片、料酒略腌去腥。虾类富含优质蛋白和锌元素，但痛风患者需控制摄入量。若发现虾肉松散、异味等变质迹象应立即丢弃。