新鲜的蘑菇在冰箱通常可以保存3-5天，实际保存时间与蘑菇品种、储存方式、冰箱温度等因素有关。
蘑菇含水量高且组织脆弱，冷藏时需保持干燥透气。未清洗的蘑菇放入牛皮纸袋或垫有厨房纸的保鲜盒中，能避免冷凝水加速腐败。香菇、平菇等常见品种在4℃冰箱中可维持3天左右的新鲜度，而金针菇、杏鲍菇因纤维较粗可能延长至5天。若蘑菇表面出现黏滑、发黑或异味，则已变质不可食用。
部分特殊品种如松茸、鸡枞菌等野生菌类保鲜期更短，冷藏超过2天风味会显著下降。采用真空密封或冷冻保存可将期限延长至1周以上，但解冻后口感会变软。购买时选择菌盖紧实、菌褶洁白的蘑菇，回家后尽快去除包装袋并用干布擦拭表面水分，能最大限度延长保鲜时间。
建议根据食用计划分批购买蘑菇，避免长期冷藏。烹饪前用流动水快速冲洗并立即沥干，不要浸泡。蘑菇富含维生素D和硒元素，隔夜存放会导致营养流失，尽量现买现吃。若需长期保存，可焯水后冷冻或制成干蘑菇，但风味和质地会有所改变。