洗过的香菇在冷藏条件下通常可保存3-5天，冷冻保存可延长至1个月。保存时间受储存方式、香菇初始状态、温度波动等因素影响。
洗后香菇需彻底沥干水分或用厨房纸吸干表面水渍，放入透气保鲜袋或垫有吸水纸的密封容器中冷藏。冷藏温度应保持在0-4摄氏度，避免与其他高水分食材接触。完整未切开的香菇比切开的保存期更长，切口处易滋生细菌导致变质。若发现表面发黏、出现黑斑或酸味则不可食用。
冷冻保存需将香菇切片或整朵焯水30秒后过冷水，沥干分装进密封袋排出空气。解冻后质地会变软，适合炖煮或炒制。部分品种如鲜冬菇因含水量高，冷冻后口感变化明显。商业预包装的真空处理可延长冷藏期至7天，但开封后仍需尽快食用。
日常储存建议优先选择干燥未清洗的香菇，使用时再清洗。冷藏保存期间定期检查状态，避免反复解冻冷冻。烹饪前再次确认无异常气味或霉斑，充分加热可降低微生物风险。搭配其他食材如胡萝卜、鸡肉等制作炖菜或汤品，既能提升营养吸收又能减少储存时间。