湿紫菜可以冷冻保存，但解冻后口感会变差。紫菜冷冻后细胞结构可能被破坏，导致质地变软、鲜味流失，建议优先选择干燥密封保存。
湿紫菜含有较高水分，直接冷冻时水分结晶会破坏藻体细胞壁，解冻后易出现绵软、碎裂的情况。短期保存可将湿紫菜沥干水分后装入保鲜袋，挤出空气密封冷冻，两周内食用完毕。若需长期储存，建议先将紫菜烘干至含水量低于15%，再放入防潮袋冷冻，可保存数月。
特殊情况下如大量采购新鲜紫菜，可分批烫煮后沥干冷冻。用沸水快速焯烫能灭活酶类，减少营养流失，分装时保留少许汤汁可减缓脱水。但该方法仍无法完全保持原有脆嫩口感，适合用于煮汤或调味，不建议直接凉拌食用。
日常建议购买干燥紫菜片，开封后密封存放阴凉处。若发现紫菜受潮发黏，可平铺烤箱60℃烘干10分钟恢复脆度。冷冻紫菜使用前无需解冻，直接烹饪能减少汁液渗出，搭配豆腐、鸡蛋等食材可弥补口感不足，避免单独作为冷食。