青柠檬和黄柠檬的主要区别在于成熟度、酸度及用途，青柠檬是未完全成熟的柠檬，酸度更高且果皮薄，适合调味或调饮；黄柠檬为成熟果实，酸味温和且果肉多汁，更适合直接食用或榨汁。
青柠檬的果皮呈现青绿色，质地较薄且表面光滑，含有丰富的挥发性芳香物质，常用于东南亚菜肴的调味或调制鸡尾酒。其酸度明显高于黄柠檬，果汁中柠檬酸和维生素C含量更集中，适合需要突出酸味的烹饪场景。未成熟状态下的青柠檬果核较小，果肉呈浅黄绿色，榨汁后易氧化变色，需尽快使用。
黄柠檬在完全成熟后外皮转为亮黄色，果皮增厚且表面纹理明显，储存时间比青柠檬更长。成熟过程使果糖含量上升，酸味相对柔和，适合制作柠檬水、甜点或直接切片食用。其果肉饱满多汁，维生素C含量虽略低于青柠檬，但整体风味更平衡。黄柠檬的果皮精油含量较高，常被加工成柠檬干或提取香精。
日常使用可根据需求选择，青柠檬适合需要强烈酸味的料理或饮品，黄柠檬更适合直接食用或温和调味。储存时均建议冷藏保存，切开后需用保鲜膜包裹避免水分流失。两类柠檬均富含维生素C和类黄酮，适量食用有助于促进铁吸收和抗氧化，但胃酸过多者应注意控制摄入量。