南瓜头和尾的口感与食用价值各有特点，头部肉质紧实适合炖煮，尾部纤维细腻适合清炒。
南瓜头部通常靠近果柄，质地较硬且淀粉含量高，蒸煮后口感绵密香甜，适合制作南瓜粥或炖菜。这部分含有丰富的类胡萝卜素和膳食纤维，长时间加热能软化粗纤维，更利于消化吸收。传统烹饪中常将头部切块与肉类同炖，既能吸收油脂又不会散烂。
南瓜尾部指靠近花萼的末端，水分含量较高且纤维更细嫩，快速翻炒可保留清脆口感。该部位维生素C和钾元素相对丰富，适合切片清炒或凉拌。因质地较软，高温短时烹饪能保持鲜艳色泽，搭配蒜末或虾仁可突出鲜甜。部分品种尾部带有自然凹槽，挖取果肉后可直接作为容器使用。
选择南瓜头尾时需结合烹饪方式，炖汤建议选用头部，追求爽脆口感可选尾部。无论哪部分都应确保南瓜新鲜无腐烂，表皮无虫蛀痕迹。南瓜富含果胶和多种矿物质，日常食用有助于胃肠蠕动，但糖尿病患者需控制摄入量。保存时切除的南瓜头尾切口可涂抹食盐防止氧化，冷藏存放不超过三天为宜。