身材矮小的病因是多种多样的，这些病因可以大致分为正常生长变异和病理性身材矮小两大类。以下是对这两大类病因的详细分析：

正常生长变异

家族性矮小：遗传因素在身高发育中起着重要作用，如果父母身材较为矮小，孩子的身高也可能受到影响。

体质性生长延迟：这种情况通常表现为青春期启动较晚，但孩子的身高可以达到正常成人水平，不需要特殊治疗。

特发性矮小：经过详细检查，没有发现任何疾病或其他明确原因导致的身材矮小，这种情况可能与遗传或目前医学尚未明确的原因有关。特发性矮小也是可以用生长激素进行治疗的。

小于胎龄儿：出生时体重和身高低于同胎龄、同性别正常婴儿标准的第10百分位以下，这些孩子在成长过程中可能会面临身材矮小的风险。

病理性身材矮小

生长激素缺乏症：生长激素是人体正常分泌的一种激素，对骨骼生长有重要促进作用。如果生长激素分泌不足，会导致孩子生长缓慢，出现矮小症。

甲状腺功能低下：甲状腺激素对骨骼和神经系统的发育至关重要。先天性甲状腺功能低下的孩子会表现为身材矮小和智力低下。

慢性疾病：如慢性贫血、营养不良、先天性心脏病、慢性肾脏或肝脏疾病等，这些疾病会影响孩子的整体生长发育，导致身材矮小。

染色体异常或基因异常疾病：如Turner综合症（特纳综合征），这是一种先天性卵巢发育不全的疾病，会导致女孩身材矮小。此外，先天性骨和软骨疾病也可能导致矮身材。

感情剥夺性身高矮小：由于家庭及环境因素导致垂体分泌促生长激素释放因子减少，从而影响身高发育。

综上所述，身材矮小的病因复杂多样，包括遗传因素、内分泌疾病、慢性疾病、染色体异常或基因异常疾病等。对于身材矮小的孩子，应及时就医进行详细检查，明确病因后采取相应的治疗措施。同时，家长也应关注孩子的营养状况和生活环境，为孩子提供良好的生长发育条件。