基因重组和染色体变异的区别在于遗传物质转移方式、是否涉及染色体结构变化、是否可逆、是否自然发生以及是否影响基因表达。

1.遗传物质转移方式

基因重组是通过交换或重排同源染色体上的DNA片段实现的;而染色体变异则是指染色体整体或部分缺失、重复、倒位等结构改变。

2.是否涉及染色体结构变化

基因重组仅涉及染色体上特定DNA序列的变化，不引起染色体结构的整体变化;染色体变异则可能导致染色体长度、形态等方面的显著改变。

3.是否可逆

基因重组通常是可逆的，因为经过重组的染色体可以再次进行重组;染色体变异通常不可逆，因为染色体结构一旦发生改变很难恢复原状。

4.是否自然发生

基因重组主要发生在有性生殖过程中，由父母双方的染色体随机组合形成子代染色体;染色体变异可以在任何情况下发生，包括环境因素的影响。

5.是否影响基因表达

基因重组可能会影响某些基因的表达，但不会导致新基因的产生;染色体变异可能导致新基因的产生或原有基因的功能丧失。

基因重组与染色体变异均为生物遗传学中常见的现象，但在机制及影响方面存在差异。研究两者之间的异同有助于深入理解生物进化过程中的遗传变异现象。