艾叶和艾蒿是同一植物的不同药用部位，艾叶指菊科植物艾的干燥叶，艾蒿则泛指全草或地上部分。二者在功效和应用上存在差异，主要有药用部位不同、有效成分含量差异、临床应用侧重、采收时节区别、炮制方法分化五点区别。
1、药用部位：
艾叶特指艾草的叶片部分，质地较厚且绒毛密集，传统以湖北蕲春产者为道地药材。艾蒿包含茎、叶、花等地上部分，茎秆木质化明显，部分地区将嫩茎叶作野菜食用。明代本草纲目明确记载"艾以叶入药"，而民间习用全草熏蒸。
2、成分差异：
艾叶挥发油含量达0.4%-1.0%，主要含桉油精、侧柏酮等活性成分，其黄酮类物质比茎部高3-5倍。艾蒿因含木质化茎秆，总有效成分浓度较低，但纤维素含量较高。现代药理研究表明，艾叶提取物抗菌效果显著优于全草。
3、应用侧重：
艾叶多用于艾灸、药枕及妇科止血方剂，如胶艾汤。艾蒿更常用于端午门悬、药浴熏洗等民俗疗法。临床治疗虚寒出血证必用纯叶，伤寒论记载的四逆汤等经方均指定使用艾叶。而艾蒿全草多用于外治皮肤瘙痒。
4、采收时节：
艾叶以端午节前后叶片肥厚时采收为佳，此时挥发油积累达峰值。艾蒿可在植株抽薹前收割全草，部分地区分季采收，春季采嫩茎作菜，秋季采老株入药。古籍千金方强调"采艾以五月五日曝干"专指叶片采收。
5、炮制方法：
艾叶需经过反复晒干、揉搓、筛净等工序制成艾绒，陈久者良。艾蒿通常切段晒干即可，部分地区采用醋蒸等特殊炮制法。艾叶炭与生艾叶功效迥异，而艾蒿较少进行炭化处理。雷公炮炙论记载艾叶"凡用须炙令香"的独特工艺。
日常使用建议根据具体需求选择，艾叶更适合精细的医疗用途，建议在中医师指导下使用。艾蒿可用于养生保健，可制作香囊驱蚊或煮水泡脚。保存时需防潮防蛀，阴虚血热者慎用。两种药材均含挥发性成分，不宜长期大量使用，孕妇使用前应咨询专业医师。搭配生姜、红花等药材可增强温经通络效果，但需辨证配伍。