湖南疾控已完成20例新冠病毒标本测序 均为德尔塔毒株

自7月28日拿到我省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来，湖南省疾控中心已完成20例德尔塔新冠病毒基因组测序。已经完成测序结果的标本均为德尔塔毒株，与南京高度同源。

5天时间已完成20例标本测序

据省疾控中心检验科科长湛志飞介绍，基因组测序可在第一时间获取新发未知病毒的基因组序列信息，已成为研究疾病暴发的重要工具。通过构建进化树，研究不同患者病毒遗传序列变化，能在分子生物学层面揭示病毒的传播方式，分析新冠病毒的进化来源，研究新冠病毒的致病病理机制，为控制疫情暴发提供科学依据。

通过检测新冠病毒的全基因组序列，再将这个序列通过算法与数据库中的数据进行比对，可以初步判断其地域来源。将序列与既往病例序列进行比对，如果序列在同一进化树分支上，则可以判断这些病例是否来自同一传播链或传染源。

面对此次疫情，从7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来，湖南省疾控已完成20例标本测序。

24小时完成病毒基因测序溯源

“新冠病毒样本送到实验室后，一般需要经过多个步骤完成检测。”湛志飞称，在接到阳性样本后，工作人员首先进行复核工作，对样本进行核酸提取，再用两种试剂进行核酸检测。复核阳性的标本，分别用二代和三代高通量测序技术进行序列测定，为病毒溯源工作设置“双保险”，确保万无一失。

病毒基因序列测定完成后，工作人员还要马上进行生物信息学分析，将病毒序列与数据库中的序列进行比对，查看有无变异位点，进行同源性比较。完成数据比对后，还要及时撰写溯源报告。

“目前，湖南省疾控中心已具备新冠病毒基因组高通量二代和三代测序能力，为湖南省新型冠状病毒疫情以及其他传染病病原体的鉴定和溯源、防控应对提供了强大的技术支撑。”湛志飞介绍，去年10月份才掌握这项技术，以前都是送到国家疾控中心检测。目前湖南省疾控中心培养了3名技术骨干，所有的新冠病毒基因组测序都能在24小时内完成，情况复杂的也不会超过48小时。根据疫情的变化，只要有标本来，都会在24小时内启动测序流程。