员工体检费一般计入职工福利费或管理费用科目，具体入账方式需根据企业财务制度和体检用途决定。
员工体检费用属于企业为职工提供的健康福利，通常通过应付职工薪酬科目核算。企业为在职员工支付的常规体检费用，可计入职工福利费二级科目，按照工资总额的14%比例税前扣除。若体检属于入职前强制要求，相关费用应计入管理费用中的招聘费科目。特殊行业如食品加工企业为满足卫生监管要求的体检支出，可列入生产成本或制造费用。体检费用报销需附正规医疗机构发票、体检项目明细及员工签字确认的付款凭证。企业为特定岗位员工投保职业健康体检的费用，可通过商业保险途径处理。
企业财务人员处理体检费用时应完整保留体检机构资质证明、费用清单及员工参与记录。年度汇算清缴时需将福利性体检支出与其他职工福利合并计算扣除限额。若体检包含高管人员或股东，需注意与个人消费的区分以避免税务风险。建议企业制定明确的体检费用管理制度，区分常规福利体检与专项职业健康检查的会计处理方式。对于外籍员工的体检费用支出，还需考虑跨境服务税务申报的特殊要求。
