闭经的原因很多，病变影响到下丘脑、垂体、卵巢，以及子宫等任何一部位时，均可发生闭经。

下丘脑垂体疾病。下丘脑垂体部位的肿瘤、炎症；先天性或后天性促性腺激素分泌不足、垂体功能减退症、神经性厌食及用避孕药后闭经。

卵巢疾病。先天性性腺发育不良、多囊卵巢综合征、卵巢男性化肿瘤及卵巢功能早衰。

子宫疾病。子宫发育不良、子宫缺如、结核及产后感染。

其它。各种原因引起的高泌乳素血症、甲亢、肾上腺皮质功能减退、肾上腺皮质肿瘤及全身性严重疾病。