清洗梭子蟹最干净的方法是先浸泡后刷洗，重点处理蟹壳缝隙和腹部。梭子蟹表面可能附着泥沙、细菌或寄生虫，需彻底清洁后食用。
梭子蟹外壳坚硬且多褶皱，需用淡盐水或清水浸泡让其吐出杂质。将活蟹放入盆中，加入没过蟹体的清水，撒少许食盐静置半小时。浸泡过程中蟹会自然排泄，部分泥沙也会沉淀。之后用硬毛刷或牙刷逐个刷洗蟹壳，尤其注意关节处、腹脐褶皱和蟹钳绒毛，这些部位易藏污纳垢。刷洗时建议戴手套避免被蟹钳夹伤，流动水下反复冲洗至水清澈为止。
若蟹已死亡或需去除内脏，可掀开蟹脐盖挤出排泄物，用剪刀剪去蟹腮和胃囊。处理冷冻蟹时需先解冻，但不宜用热水浸泡以免影响肉质。清洗后建议尽快烹饪，避免长时间存放滋生细菌。蒸煮前可用料酒或姜片水短暂浸泡去腥。
清洗后的梭子蟹建议清蒸或爆炒，高温烹饪可进一步杀菌。食用时搭配姜醋汁既能提鲜又有助于中和寒性。日常储存活蟹可覆盖湿毛巾置于冷藏室，保持湿润环境可存活较长时间。死蟹易产生组胺毒素，若发现蟹体发软、有异味则不可食用。海鲜过敏者应谨慎尝试，脾胃虚寒人群建议佐以姜茶驱寒。
