菠萝蜜保存时建议密封处理。密封可减少水分流失和氧化，延长保鲜期，但需注意避免高温环境导致发酵变质。
菠萝蜜果肉含糖量高且质地柔软，密封保存能有效阻隔空气接触，减缓果肉氧化变色和微生物滋生。使用保鲜盒或食品级密封袋包裹后冷藏，可维持3-5天口感新鲜。若切开后未食用完毕，需去除果核并用保鲜膜紧密包裹切口部位，防止汁液渗出污染冰箱环境。
短期存放可选择透气方式，如阴凉通风处放置未切开的全果，但成熟度高的菠萝蜜在透气环境下容易吸引果蝇或加速局部腐烂。整果保存时可用报纸包裹后置于纸箱，避免阳光直射导致果皮干裂。若发现果柄渗出白色汁液，说明果实已过熟，需尽快食用不宜继续存放。
保存菠萝蜜时需根据成熟度和食用计划选择方式，完整未切开的果实可短暂透气存放，已切开的果肉必须密封冷藏。日常避免与榴莲、芒果等释放乙烯的水果混放，存放前检查果皮有无机械损伤，出现酒味或发黏现象应立即丢弃。食用前建议用盐水浸泡果肉以降低致敏风险，胃肠功能较弱者需控制单次摄入量。
