榴莲烤熟后可以放一晚上，但需冷藏保存并密封处理。若室温较高或存放环境潮湿，可能加速变质。
榴莲烤熟后糖分和水分含量较高，在常温下容易滋生细菌。夏季或湿热环境中，室温超过4小时可能引发微生物繁殖，导致果肉发酸或霉变。冷藏温度控制在4℃以下可抑制大部分细菌活性，密封容器能减少氧化和串味。若榴莲已出现酒味、黏液或颜色发暗，则不建议继续食用。
部分情况下隔夜保存的烤榴莲仍可食用，如冬季低温环境或使用真空包装。但反复加热会导致营养流失，尤其是维生素B族和维生素C受热易分解。糖尿病患者更需注意隔夜榴莲的糖分浓缩问题，可能影响血糖控制。若需长时间保存，建议分装冷冻，食用前用烤箱复热至70℃以上杀菌。
保存烤榴莲时建议使用玻璃保鲜盒，避免与海鲜、乳制品等易致敏食物混放。食用前检查是否有异味或质地变化，肠胃敏感者应谨慎食用隔夜榴莲。日常可搭配山竹、菠萝等富含蛋白酶的水果帮助消化，但不宜与高蛋白食物同食以免加重胃肠负担。若出现腹泻等不适症状，应及时就医排查食物中毒可能。
