豆芽清洗时需摘除根部并反复漂洗，重点去除豆壳和杂质。豆芽清洗方法主要有流水冲洗、淡盐水浸泡、白醋水杀菌、淘米水去污、沸水快速焯烫等。
1、流水冲洗
将豆芽放入沥水篮中用流动清水冲洗2-3分钟，手指轻轻搅动使豆壳分离。冲洗时注意检查芽体是否腐烂，变褐或发黏的豆芽应当丢弃。此方法适合时间紧张时快速清洁，但对顽固杂质去除效果有限。
2、淡盐水浸泡
用3%浓度的盐水浸泡豆芽5分钟，盐分能帮助析出残留农药并使豆壳浮起。浸泡后需再用流水冲洗，避免盐分残留影响口感。该方法对超市购买的袋装豆芽特别有效，可溶解表面防腐剂。
3、白醋水杀菌
按1：10比例将白醋与清水混合，浸泡豆芽3分钟后冲洗。醋酸能杀灭部分致病菌并中和碱性污染物，尤其适合凉拌生食的豆芽处理。处理后的豆芽会有轻微酸味，建议后续用清水漂洗1次。
4、淘米水去污
用淘洗过大米的浑浊水浸泡豆芽8分钟，淀粉颗粒能吸附细小杂质。该方法环保经济且能保持豆芽脆嫩，但需确保淘米水本身清洁无霉变。较适用于农家自产带大量豆壳的粗壮豆芽。
5、沸水快速焯烫
将豆芽放入沸水中焯烫10秒立即过冷水，高温能灭活大部分微生物并提升口感脆度。注意控制时间避免过熟，焯烫后需立即烹饪不宜久放。此方法处理后的豆芽适合爆炒等高温烹调方式。
豆芽作为高水分蔬菜，建议现洗现吃避免长时间浸泡。清洗后若需保存，应沥干水分装入透气容器冷藏不超过24小时。选购时注意芽体挺直、无褐斑且根部短小，散装豆芽需特别加强清洗。日常可将不同清洗方法组合使用，如先盐水浸泡再流水冲洗，兼顾效率与安全性。脾胃虚寒者建议彻底加热后食用，凉拌豆芽需确保清洗杀菌到位。
