牡蛎粉通常由牡蛎肉制成，而非牡蛎壳。牡蛎粉是通过干燥、粉碎牡蛎肉得到的营养补充品，富含优质蛋白、锌、牛磺酸等成分；牡蛎壳粉则需经过高温煅烧等特殊处理，主要成分为碳酸钙，多用于补钙或工业用途。
牡蛎粉的制作原料主要为新鲜牡蛎肉。将牡蛎肉清洗后经低温干燥工艺脱水，保留其天然营养成分，再通过精细研磨制成粉末。这种加工方式能最大限度留存牡蛎中的活性物质，如锌元素含量可达每百克超过50毫克，对增强免疫力、改善男性生殖健康具有辅助作用。牡蛎粉还含有丰富的牛磺酸和糖原，适合体质虚弱者或运动后补充能量。
牡蛎壳粉的原料为废弃牡蛎壳，需经过清洗、高温煅烧去除有机杂质，再研磨成细粉。其主要成分是碳酸钙，钙含量可达35%以上，常作为钙剂添加在饲料或保健品中。由于牡蛎壳质地坚硬，直接食用难以消化吸收，故需特殊工艺处理。部分传统医学会将煅烧后的牡蛎壳粉入药，用于中和胃酸或收敛止血，但与牡蛎粉的营养价值差异显著。
选择牡蛎类产品时应根据需求区分原料来源。牡蛎粉适合需要补充微量元素和蛋白质的人群，食用时可加入粥品或奶昔；牡蛎壳粉更适合缺钙者，但需注意其吸收率较低。两类产品均可能引起海鲜过敏，初次食用建议小剂量测试。保存时需防潮避光，开封后尽快用完以确保活性成分不被氧化。
