螃蟹清洗内脏需重点处理胃囊、鳃和肠线，可采用刷洗、浸泡、冲洗三步法确保食用安全。
螃蟹外壳附着的泥沙和内脏残留需彻底清理。准备硬毛刷或牙刷，在流动水下反复刷洗蟹壳缝隙与腹盖处，重点清洁蟹脚关节和螯足绒毛。剪开腹盖后找到位于蟹壳前端的三角形胃囊，用镊子或刀尖挑出丢弃。掀开蟹壳顶部，去除两侧呈灰白色的条状鳃叶，这些是螃蟹的呼吸器官易积累污染物。最后捏住蟹身中段，轻轻扯出连接腹部的透明肠线，避免断裂残留。处理过程中建议佩戴手套防止被蟹钳夹伤，活蟹可先冷冻20分钟使其进入休眠状态。
部分螃蟹如大闸蟹的肠线较粗且贯穿全身，需从腹部末端小心抽出。梭子蟹内脏分布较散，可对半切开后逐一剔除。河蟹的胃囊与肝脏连接紧密，清除时注意区分深褐色肝脏可保留食用。海蟹鳃部可能附着海藻或寄生虫卵，需用盐水浸泡10分钟再冲洗。死蟹内脏腐败速度快，若发现鳃部发黑或腹部有异味应整只丢弃。
清洗后的螃蟹建议用姜片、料酒腌制去腥，蒸制时腹部朝上防止蟹黄流失。胃肠敏感者食用前可去除全部内脏，搭配姜醋汁中和寒性。避免食用未彻底加热的醉蟹或生腌蟹，处理工具需用沸水消毒防止交叉污染。螃蟹属高嘌呤食物，痛风患者应控制摄入量，过敏体质者首次尝试需观察反应。