蘑菇焯水主要是为了去除杂质、降低有害物质含量并提升口感。焯水能有效清除蘑菇表面附着的灰尘、虫卵及部分农药残留，同时破坏可能存在的微量毒素如肼类化合物，减少胃肠刺激风险。草酸和嘌呤等成分在高温水煮过程中也会部分溶出，对痛风或高尿酸人群更为友好。部分野生蘑菇通过焯水可显著减弱土腥味，使肉质更紧实爽滑，尤其适合炖汤或凉拌做法。从食品安全角度，焯水是处理蘑菇的关键步骤，但时间需控制在1-2分钟避免营养流失。
焯水过程中蘑菇细胞壁受热破裂，有助于释放更多鲜味物质，这也是菌汤鲜美的科学原理。香菇等品种含有的香菇嘌呤经焯水后浓度下降，对代谢负担较轻。高温还能灭活蘑菇中可能存在的酪氨酸酶，防止切面氧化变黑影响观感。实验表明焯水后的蘑菇重金属含量比未处理组降低明显，镉、铅等有害元素随沸水渗出。对于榛蘑等东北常见野生菌，焯水后挤干水分再烹调，能避免成品发苦。
部分特殊品种如金针菇因菌丝细嫩，长时间焯水会导致口感软烂，快速汆烫10秒即可。新鲜松茸等高档品种为保留香气，专业厨师常采用冰水快速焯烫法。杏鲍菇等肉质厚实的品种，建议切薄片后焯水确保受热均匀。需注意焯水后的蘑菇不宜长时间浸泡，维生素B族等水溶性营养素会持续流失。商业种植的双孢蘑菇因人工培育环境可控，焯水时间可缩短至30秒。
日常处理蘑菇建议用沸水加少量食盐或白醋，既能加速杂质析出又能保持色泽。焯水后立即过冷水能锁住弹性，凉拌菜应用时口感更佳。不同烹饪方式可灵活调整焯水时长，爆炒类菜肴可缩短时间保留脆度，炖煮类则可适当延长确保安全。特殊人群如孕妇或消化功能弱者，建议所有菌菇类食材充分焯水后再烹调。若发现蘑菇焯水后水质异常浑浊或散发异味，应立即丢弃避免食物中毒风险。保存焯过水的蘑菇需沥干水分冷藏，并在24小时内食用完毕。