酸枣蜜一般建议适量食用，过量摄入可能引起胃肠不适或血糖波动。酸枣蜜含糖量较高，且可能含有微量生物碱成分，特殊人群需谨慎。
酸枣蜜由酸枣花蜜酿制而成，其糖分以果糖和葡萄糖为主，升糖指数较高。糖尿病患者或血糖控制不佳者过量食用可能导致血糖快速上升，不利于病情控制。部分酸枣蜜因原料特性可能残留少量天然生物碱，敏感人群长期大量摄入可能引发轻微头晕或消化不适。酸枣树生长环境中若存在农药残留，也可能通过蜜源植物转移至蜂蜜中。
酸枣蜜在传统工艺加工过程中，高温处理可能导致部分营养成分流失。市售产品若未经过严格过滤，可能含有微量枣核碎屑，胃肠功能较弱者食用后可能出现腹胀。部分人群对枣类花粉存在交叉过敏反应，首次食用需观察是否出现皮肤瘙痒或呼吸道不适症状。酸枣蜜的酸性成分可能对牙釉质产生轻微腐蚀作用，食用后建议清水漱口。
日常食用酸枣蜜建议每日不超过20克，可搭配无糖酸奶或全麦面包降低升糖负荷。儿童、孕妇及消化系统疾病患者应在营养师指导下食用，避免空腹饮用浓蜜水。
选择正规渠道产品并注意观察保质期，开封后需冷藏保存。若出现腹泻或过敏症状应立即停用，蜂蜜不宜用于一岁以下婴儿辅食添加。