黑玉米一般需要煮20-30分钟才能完全熟透，具体时间受到玉米大小、火力大小、是否提前浸泡等因素影响。
黑玉米属于粗粮中质地较硬的品种，其外层的种皮较厚且富含花青素等抗氧化物质，这导致它的烹煮时间比普通黄玉米略长。新鲜的黑玉米若未提前浸泡，冷水下锅后需大火煮沸再转中火持续烹煮，整个过程中保持水量淹没玉米。若使用高压锅烹饪，时间可缩短至10-15分钟，高压能更快软化玉米的膳食纤维。判断熟透的标准是玉米粒饱满膨胀，用筷子能轻松穿透玉米芯部分。
冷冻黑玉米需要完全解冻后再煮，否则外层熟透时内部仍可能夹生。若玉米过于老硬或存放时间较长，可适当延长5-8分钟烹煮时间，但过度烹煮会导致花青素等营养素流失。带叶烹煮能保留更多风味，但需注意清洗干净叶缝杂质。部分品种的黑玉米颗粒特别紧实，建议对半切开后烹煮以加速热力渗透。
建议选择当季新鲜黑玉米，烹煮前用清水浸泡30分钟可缩短时间。煮熟后尽快食用能获得最佳口感，剩余玉米可冷藏保存但不宜超过2天。黑玉米食用时搭配适量蛋白质食物如鸡蛋或豆制品，有助于提高铁元素的吸收率，但胃肠功能较弱者需控制单次食用量避免腹胀。