菠萝中间颜色深一般可以吃，但需根据具体情况判断。菠萝果肉变深可能是成熟度过高或局部氧化导致，若伴有异味或霉变则不建议食用。
菠萝果心颜色变深常见于成熟度较高的果实，糖分聚集会使果肉颜色加深呈半透明状，口感更甜软但营养价值不变。这类情况多见于储存时间较长的菠萝，切开后接触空气氧化也会导致局部褐变，用清水冲洗后仍可安全食用。选择时注意按压果皮有弹性、叶片易拔出的成熟菠萝，切开后颜色均匀的果肉更适合直接食用。
若菠萝果肉出现大面积发黑、渗水或带有酒精味，可能因储存不当导致发酵或霉变。霉变菠萝会产生展青霉素等毒素，即使切除变色部分仍有污染风险。部分品种如巴厘菠萝的果心本身颜色偏深，但质地坚硬无异味。建议购买后尽快食用，未切开的完整菠萝可冷藏保存，切开后需用保鲜膜包裹并两天内吃完。
日常食用菠萝可补充维生素C和锰元素，但空腹大量进食可能刺激口腔黏膜。建议用淡盐水浸泡切片后再食用，胃肠敏感者每日摄入量控制在200克以内。挑选时优先选择叶片翠绿、果皮金黄的菠萝，切开后尽快食用可减少氧化变色概率。