腌辣椒在常温下一般可保存1-2周，冷藏可延长至1-2个月，具体时间受密封性、盐分浓度、环境温度等因素影响。
腌辣椒的保存时间与制作工艺密切相关。传统水封泡菜坛腌制的辣椒因隔绝空气且乳酸菌活跃，常温下可存放较久。盐渍辣椒因高渗透压抑制微生物，未开封时保质期较长。添加蒜、姜等天然抑菌成分的腌辣椒能延缓变质。玻璃罐密封冷藏的腌辣椒可最大限度保留风味。若使用真空包装并灭菌处理，保存期可进一步延长。
腌辣椒变质的风险主要来自储存不当。开封后未及时冷藏可能导致杂菌污染。盐分不足或腌制时间过短易引发霉变。使用生水或容器不洁会加速腐败。环境温度波动大可能破坏发酵平衡。出现异味、发黏或变色时应立即丢弃。
建议将腌辣椒存放在阴凉干燥处，避免阳光直射。使用干净餐具取用可减少污染，定期检查容器密封性。若需长期保存，可分批小包装冷冻，但解冻后口感可能变软。自制腌辣椒应确保原料新鲜，严格消毒容器，控制盐糖比例，发酵初期每日观察状态，出现异常及时处理。