柠檬水可以煮沸后饮用，但高温会破坏部分维生素C等营养成分。柠檬水煮沸后酸味可能更明显，适合搭配蜂蜜或冰糖调味，但胃酸过多者需谨慎。
柠檬水煮沸时，水温超过80度会导致维生素C大量流失，但柠檬中的矿物质和部分活性成分仍可保留。煮沸后的柠檬水更适合秋冬季节温热饮用，可加入少量姜片增强驱寒效果。对于口腔溃疡或咽喉不适人群，温热的柠檬水能缓解刺激感，但需避免空腹饮用。若追求营养最大化，建议用60度以下温水冲泡鲜柠檬片。
特殊情况下，如制作柠檬膏或止咳偏方时需要煮沸柠檬，此时会加入大量冰糖或蜂蜜中和酸度。糖尿病患者需控制添加糖量，可用代糖替代。煮沸后的柠檬皮会释放更多苦味物质，对胃肠敏感者可能引发不适。若用于杀菌目的，煮沸1-2分钟即可达到效果，长时间烹煮反而会加重苦涩感。
日常饮用柠檬水建议选择鲜柠檬现泡，保留更多营养成分。煮沸后的柠檬水可适当搭配薄荷叶或枸杞调节风味，避免与含铝器具接触以防产生化学反应。胃肠功能较弱者应注意饮用温度与浓度，出现反酸症状时应减少摄入量，必要时咨询营养师调整饮食方案。