苹果的保质期一般为7天到30天，实际保存时间受到品种差异、储存温度、成熟度、表皮完整性和湿度条件等多种因素的影响。
不同品种的苹果耐储性差异较大，红富士等晚熟品种因皮厚果肉致密，冷藏条件下可保存20到30天；嘎啦等早熟品种果皮较薄，常温下仅能保存7到10天。储存温度是决定性因素，冰箱冷藏室的4℃环境能显著延缓呼吸作用，使保质期延长至3周以上，而25℃以上室温会加速水分流失和软腐，保质期缩短为1周左右。
采摘时的成熟度直接影响后续储存，未完全成熟的青果含有更多果酸和单宁，储存期比完全成熟的果实延长5到7天。表皮存在机械损伤或虫蛀的苹果，微生物易从伤口侵入导致局部腐烂，这类果实即使在冷藏条件下也仅能保存3到5天。湿度过高会促进霉菌滋生，湿度过低则导致失水皱缩，保持85%左右相对湿度配合透气包装，能最大限度维持苹果新鲜度。
建议将苹果置于冰箱蔬果保鲜盒并保留原包装，避免与香蕉等乙烯释放量大的水果混放。定期检查剔除开始变软的个体，完整无损的苹果可冷冻制成苹果块长期保存。购买时选择果柄新鲜、果霜完整、无淤伤的果实，采用真空密封袋分装能进一步延长储存时间。