怀孕43天可以进行药物流产，但不可以进行人工流产。

怀孕43天时胚胎尚未形成，无法进行人工流产手术，因此需要使用药物流产的方式进行终止妊娠。药物流产是指在医生指导下服用米非司酮片、米索前列醇等药物以达到终止早期妊娠的目的。与人工流产相比，药物流产对子宫内膜损伤较小，恢复时间相对较短。但是，药物流产也存在一定的风险和并发症，如不完全流产、感染等，需密切监测并及时就医。

如果孕妇有严重的合并症或并发症，则不能进行人工流产，如多胎妊娠、宫颈机能不全等。这些情况下进行人工流产可能会增加出血、感染和其他并发症的风险。

无论选择哪种方式结束妊娠，都应确保身体得到充分休息，并按医嘱进行适当的术后护理。同时，建议定期复查以评估身体恢复情况。