有囊肿不一定会影响怀孕，具体需根据囊肿类型、大小及位置综合判断。生理性囊肿如黄体囊肿通常不影响受孕，而病理性囊肿如巧克力囊肿可能降低怀孕概率。
卵巢囊肿是育龄期女性常见问题，其中功能性囊肿占多数。这类囊肿与月经周期相关，如卵泡囊肿和黄体囊肿，通常在2-3个月经周期内自行消失，不会对生育功能造成持续影响。部分女性在排卵期可能出现暂时性囊肿，这反而是正常排卵的标志。对于这类情况，建议通过超声监测囊肿变化，同时保持规律作息和均衡饮食，适当补充维生素E和叶酸有助于卵泡发育。
子宫内膜异位囊肿和畸胎瘤等病理性囊肿可能对怀孕产生阻碍。子宫内膜异位囊肿会破坏卵巢组织储备，导致卵子质量下降，同时可能引发盆腔粘连。畸胎瘤若体积较大可能压迫输卵管影响受精卵运输。多囊卵巢综合征患者虽然卵巢呈多囊样改变，但实际囊肿为未成熟卵泡，其核心问题是排卵障碍而非囊肿本身。对于这类情况需通过腹腔镜手术评估囊肿性质，术后配合药物调节激素水平，必要时可考虑辅助生殖技术。
备孕期间发现囊肿应进行妇科超声和肿瘤标志物检查，直径小于5厘米的无症状囊肿可先观察。日常避免剧烈运动防止囊肿扭转，减少高雌激素食物摄入，定期复查监测囊肿变化。若尝试自然受孕半年未成功，建议到生殖中心进行卵巢功能评估和输卵管通畅度检查。