中医可以辅助治疗肛瘘，但无法彻底根治。肛瘘是肛周脓肿破溃或引流后形成的慢性感染性管道，主要需通过手术清除病灶。中药内服、外用或针灸可作为术前术后辅助手段缓解症状。
肛瘘多与湿热下注、气血瘀滞相关。中药熏洗常用清热解毒的复方制剂如苦参汤加减，能减轻局部红肿疼痛；口服槐角丸可凉血止血，改善便血症状。针灸选取长强、会阴等穴位促进气血流通，但无法闭合瘘管。对于高位复杂性肛瘘，中医辅助需配合现代医学影像定位，避免延误手术时机。
肛瘘形成后，瘘管内壁已上皮化，自愈可能性极低。传统挂线疗法虽属中医经验方法，但本质仍是机械性切割，需由专科医生操作。部分患者尝试单用中药可能导致感染扩散或假性愈合，反复发作会增加手术难度。尤其伴有糖尿病、克罗恩病等基础疾病时，更需优先考虑手术治疗。
肛瘘患者应保持肛门清洁干燥，避免辛辣刺激饮食。术后可配合补气养血的中药调理体质，如归脾丸促进创面愈合。定期复查确认瘘管完全切除，防止复发。若出现分泌物增多、发热等症状需及时就医，不可迷信偏方延误治疗。