肚子不舒服或肚子疼时一般不建议吃大蒜。大蒜虽有杀菌消炎作用，但其辛辣成分可能刺激胃肠黏膜，加重腹痛或不适。若因受寒或轻微消化不良引起的不适，少量食用可能缓解症状；但存在胃炎、肠炎等炎症时，则可能加重病情。
大蒜中的大蒜素具有抗菌和促进消化的作用，对于因饮食不洁或受凉导致的轻微腹胀、消化不良，少量食用可能帮助缓解症状。中医认为大蒜性温，能散寒暖胃，适合寒性腹痛者搭配红糖水或生姜同服。但需注意，生蒜刺激性较强，建议捣碎后静置10分钟释放有效成分，或选择蒸煮后食用。
当腹痛伴随胃灼热、腹泻或已知患有胃肠溃疡、急性胃肠炎时，大蒜的强刺激性会直接损伤黏膜，导致疼痛加剧。部分人群对大蒜敏感，可能诱发过敏性肠炎，出现痉挛性腹痛。此时应避免生蒜、蒜泥等形态，连蒜蓉调味品也需谨慎。
胃肠不适期间饮食宜清淡温和，可选用小米粥、山药羹等养护黏膜。若腹痛持续超过6小时或伴随发热、便血，须及时就医排查病因。日常调理可尝试将大蒜煮熟后少量入菜，或饮用蒜瓣煮水去渣，既保留活性成分又降低刺激性。