1、脑脓肿：初期难鉴别，可试验治疗，无效者可行活检。

2、带状疱疹病毒性脑炎：胸腰部带状疱疹史、病情轻、预后好，以及CSF检出该病毒抗体，借此鉴别。

3、肠道病毒性脑炎：夏秋多见、病初胃肠道症状，PCR检出CSF中病毒DNA。

4、巨细胞病毒性脑炎：少见，常见于免疫缺陷如AIDS或长期应用免疫抑制剂患者，亚急性或慢性病程，体液见巨细胞、PCR检出CSF中病毒DNA。

5、急性播散性脑脊髓炎：有感染或接种疫苗史，脑和脊髓受损，出现相应体征。