引起卵巢囊肿的原因有以下几点：

一、内分泌因素

在日常生活中，卵巢囊肿一般出现在未产妇或未育妇的身上比较做，并且随着时间流逝这样的患者越来越多，而妊娠对卵巢癌似有保护作用；月经初潮偏早、绝经时间在50岁之后、月经过频、应用促排卵剂超过3个周期、性早熟或男性化等也与卵巢囊肿的原因有关。这些都是常见的引起卵巢囊肿的原因。

二、环境因素

膳食结构不合理，高胆固醇饮食、而维生素A、C、E的缺乏、吸烟、电离辐射等环境因素与其发生有关。

三、长期的饮食结构

生活习惯不好、心理压力过大等因素造成体质过度酸化，人体整体的机能下降，引起肾虚，肝肾同源，肾卵巢囊肿病理虚肝亦虚，进而引起下焦代谢循环变慢，造成卵巢疾病和内分泌失调，免疫功能下降，从而发展为卵巢组织异常增生，终致卵巢囊肿，甚至癌变。

四、身体组织液酸化

细胞处于酸性体液中，进而身体正常细胞溶氧量下降，造成细胞的活性下降，代谢循环减慢，下降到正常值的65%时，正常细胞就无法生存，但也有不惜改变染色体采取主动变异的细胞，细胞的表型发生改变，这些细胞迅速扩增，从而形成真正的肿瘤实体。

五、遗传和家族因素

有四分之一的卵巢囊肿患者在其直系的亲属当中，就会有肿瘤的患者，这也是导致卵巢囊肿病因之一。