肛门流白色透明黏液是否会自愈，需要根据导致患者出现流白色透明黏液的疾病进行判断。如果导致患者肛门流白色透明黏液的疾病为肛周湿疹、毛囊炎等，可能会自愈。但如果患有肛周脓肿、肛瘘等疾病，一般情况下大多不会自愈，通常需要接受正规治疗才可能被治愈。

一、可能会自愈：

1、肛周湿疹：如果肛门处总是处于潮湿、出汗的状态，便后对于肛门处清洁不佳，长期易导致肛门局部皮肤出现糜烂、红斑、渗出等症状，可见白色透明黏液流出，伴有局部潮湿、瘙痒。一般通过保持肛门局部清洁，便后及时擦净肛门，穿宽松内裤，保持局部清爽干燥，部分患者可逐渐自愈。少数不能自愈的患者，或症状较为严重，需及时入院就诊；

2、毛囊炎：肛周皮肤出现毛囊炎，主要为肛周局部皮肤代谢异常，或因汗毛孔分泌堵塞、角质层分泌物积聚，导致毛囊炎的发生，初期毛囊炎会出现发红、肿痛等症状，后期毛囊炎会出现化脓，流出白色透明黏液。一般也只需要平时保持肛门清洁卫生、干燥即可，大部分都能自愈。

二、可能不会自愈：

1、肛周脓肿：为肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，其特点是自行破溃，流出白色透明黏液，伴随疼痛、红肿发热、坠胀不适等症状。由于此病属于急性化脓性感染，建议发病时立即进行手术治疗，以免病情加重，导致慢性感染。因此，此病导致的肛门流白色透明黏液通常不能自愈；

2、肛瘘：一旦形成肛瘘，一般无自愈可能，手术治疗是唯一的治愈性手段。肛瘘多为一般化脓性感染所致，少数为特异性感染，主要临床症状为肛瘘外口反复流出黏性白色透明或脓性、血性分泌物，需要及时进行处理。