怀孕期间，甲状腺及其产生的甲状腺激素水平发生变化，可能会发生甲状腺功能减退等甲状腺疾病。碘缺乏也是一个引发甲状腺疾病的因素，因为怀孕和哺乳期间对碘的需要量增加。其它引起甲状腺疾病的原因包括桥本甲状腺炎，这是一种自身免疫性甲状腺疾病，由免疫系统异常攻击和破坏甲状腺细胞造成。在怀孕期间一些激素水平的变化会诱使上述自身免疫的紊乱，使甲状腺疾病容易出现。