核磁共振和CT检查的主要区别在于成像原理和适用场景，CT检查利用X射线成像，对骨骼、肺部及急性出血显示更佳；核磁共振利用磁场成像，对软组织、关节、脊髓及脑部病变显示更清晰。
CT检查的优点在于扫描速度快，通常几分钟内即可完成，对于急诊外伤、脑出血、肺部炎症及骨折等情况的诊断具有明显优势。CT检查能清晰显示骨骼结构，对于肺部小结节和钙化灶的检出率较高。核磁共振的优点在于对软组织分辨率极高，能清晰显示肌肉、肌腱、韧带、关节软骨、脊髓及脑部灰白质等结构，对于脑梗死、脑肿瘤、椎间盘突出、关节损伤及韧带撕裂等疾病的诊断价值更高。核磁共振没有电离辐射，对需要反复检查的患者更为安全。CT检查的缺点在于存在电离辐射，对软组织分辨率不如核磁共振。核磁共振的缺点在于扫描时间较长，通常需要15-30分钟，对患者配合度要求高，体内有金属植入物如心脏起搏器、动脉瘤夹等的患者不能进行检查，且对钙化灶和骨骼的显示不如CT。
在日常诊疗中，医生会根据具体病情和检查目的选择最合适的影像学方法。对于怀疑脑出血、肺部感染或骨折的急诊患者，CT检查是首选。对于怀疑脑梗死、椎间盘突出、关节韧带损伤或软组织肿瘤的患者，核磁共振则更具优势。患者在接受检查前，应告知医生自己的病史及体内是否有金属植入物，并遵循医生的指导进行准备。检查后无需特殊护理，但需注意保持充足休息，避免过度劳累，多饮水有助于身体代谢。
