HPV检查可能存在误差，但概率较低。HPV检测通常采用分子生物学方法，准确性较高，但采样不当、样本污染或实验室操作失误可能导致假阴性或假阳性结果。
规范的采样流程和实验室质控可最大限度减少误差。采样时需使用专用刷头充分接触宫颈转化区，若采样部位不准确或细胞量不足，可能漏检病毒。实验室处理中，样本保存不当或试剂失效也可能影响结果。部分低危型HPV因病毒载量低或间歇性脱落，可能出现一过性检测阴性。免疫功能正常者可能在一定时间内自然清除病毒，导致复查结果差异。
特殊情况下需考虑误差可能。不同检测技术敏感度存在差异，如HC2法可能与非HPV序列交叉反应导致假阳性，而分型检测对某些罕见亚型灵敏度不足。近期阴道用药、冲洗或性生活可能干扰检测结果。合并宫颈急性炎症时，炎性分泌物可能稀释病毒含量。极少数实验室可能出现样本混淆或结果误判。
建议结合TCT检查结果综合判断，必要时3-6个月后复查。保持规律作息有助于维持免疫功能，复查前48小时避免阴道冲洗及性生活。若持续感染高危型HPV或伴有宫颈病变，需遵医嘱进行阴道镜评估。
