清洁度二度仍有炎症可能与阴道微生态失衡、局部免疫力下降等因素有关。阴道清洁度二度属于正常范围，但若合并pH值异常或病原体感染，仍可能出现炎症反应。
阴道清洁度分为四度，二度表示阴道分泌物中白细胞和上皮细胞比例适中，属于正常生理状态。但部分女性在清洁度二度的基础上，可能因频繁冲洗、抗生素滥用等行为破坏微环境平衡，导致条件致病菌过度繁殖。常见如加德纳菌、念珠菌等微生物异常增殖时，虽未引起清洁度恶化，但已诱发瘙痒、异味等炎症表现。
少数情况下，特殊病原体感染初期也可能出现类似现象。如支原体、衣原体等微生物感染时，阴道分泌物检查可能暂时显示清洁度二度，但实际已存在宫颈管或尿道黏膜的炎症反应。这类病原体需通过PCR检测等特殊检查才能明确诊断，普通白带常规检查可能出现假阴性结果。
建议出现外阴不适症状时，除常规白带检查外还应进行阴道微生态评估和病原体筛查。日常避免过度清洁，选择棉质内裤并保持干燥，必要时在医生指导下使用乳酸菌阴道胶囊等微生态制剂调节菌群平衡。若确诊特异性感染，需规范完成抗生素疗程，伴侣同治可预防反复感染。