体检费用通常计入管理费用或应付职工薪酬科目，具体需根据体检用途和受益对象确定。
企业为员工支付的体检费用属于职工福利范畴，一般通过应付职工薪酬科目核算。这类体检通常包括入职体检、年度健康检查等，费用由企业承担并纳入员工福利支出。体检项目可能涵盖血常规、尿常规、肝功能等基础检查，部分企业还会增加心电图、胸片等专项检查。体检机构会根据检查项目开具正规发票，企业凭票进行账务处理。体检费用标准受地区经济水平和体检套餐内容影响，一线城市三甲医院的全面体检套餐费用通常高于基础体检项目。
特殊用途的体检费用可能计入其他科目。例如医疗机构为患者提供的体检服务收入计入主营业务收入，医药企业为临床试验志愿者支付的体检费用计入研发支出。体检中心采购医疗设备产生的费用应计入固定资产，耗材费用计入库存商品科目。体检机构支付给医护人员的劳务费用需计入劳务成本科目。不同行业的会计处理存在差异，需结合具体业务实质判断。
建议企业财务人员根据体检发票用途栏备注信息准确归类，福利性体检费用需合并计算员工个人所得税应纳税所得额。医疗机构应区分体检业务成本与日常运营成本，研发机构需单独核算受试者体检费用。保留完整的体检协议、费用清单和付款凭证，便于税务核查时提供依据。定期体检有助于提升员工健康水平，企业可制定合理的体检福利预算并规范财务处理流程。