菠萝蜜一般能用水洗，但需注意清洗方式和果肉处理细节。
菠萝蜜表面有密集的刺状突起和粘性汁液，直接冲洗可能导致污垢残留。建议先用厨房纸巾擦拭表皮粘液，再以流动清水配合软毛刷轻刷表面凹陷处。清洗时保持果蒂朝上，避免污水渗入果肉缝隙。对于已切开的果肉，可用淡盐水浸泡后沥干，既能清洁又能降低致敏风险。
若菠萝蜜表皮存在霉斑或腐烂，水洗无法消除霉菌污染，需丢弃变质部分。部分品种的菠萝蜜成熟后汁液氧化发黑，属于正常现象，但若伴有异味或果肉软化则不宜食用。清洗后的菠萝蜜需尽快食用，避免潮湿环境滋生细菌。
处理菠萝蜜时可佩戴手套防止汁液沾手，粘液接触皮肤可能引发瘙痒。建议选择成熟度适中的果实，未完全成熟的菠萝蜜含有更多致敏物质。日常储存时置于阴凉通风处，切开后冷藏不超过两天。对热带水果过敏者初次食用应少量尝试，出现口唇发麻等反应需立即停止进食。
